L'Acadèmia Palestina de Ciència i Tecnologia va ser fundada el 1994 per l'Organització per a l'Alliberament de Palestina a petició de la UNESCO. Va ser establerta oficialment pel Decret Presidencial núm. 114 el 1997, reconeixent el seu estatus com a organització autònoma, no governamental i sense ànim de lucre. Aquest decret va facultar l'Acadèmia per servir com a principal organisme de ciència i tecnologia al país, amb l'encàrrec d'assessorar sobre la formulació de polítiques, programes i projectes per donar suport al desenvolupament nacional, i coordinar les activitats científiques i tecnològiques (C&T) pertinents. En conseqüència, l'Acadèmia s'ha convertit en el centre neuràlgic i l'organització paraigua de la ciència i la tecnologia a Palestina.
El Dr. Fathi Arafat va ser nomenat com el seu primer president, amb Sa Majestat Yasser Arafat, president de l'Autoritat Nacional Palestina, com a president honorari.
El 1998, el Dr. Rafiq Al-Husseini va ser nomenat primer secretari general de l'Acadèmia. El Dr. Mohamed Ziara el va succeir com a secretari general en funcions l'any 2000, seguit pel Dr. Imad Al-Khatib a principis del 2001, que inicialment va exercir com a secretari general en funcions abans de ser nomenat secretari general més tard aquell mateix any. El Dr. Hikmat Ajjuri va ser nomenat vicepresident de l'Acadèmia.
L'estatus de l'Acadèmia va ser reafirmat per Decret presidencial núm. 13 del 2004 (En English) , establint-la encara més com una institució nacional, independent i autogovernada. L'Acadèmia Palestina de Ciència i Tecnologia juga un paper fonamental en l'avanç de la ciència, la tecnologia i la innovació a Palestina i en l'aprofitament d'aquestes com a motors del desenvolupament econòmic, social i humà. Per aconseguir-ho, l'Acadèmia treballa estretament amb socis del món acadèmic, governamental i industrial, tant a nivell local com internacional. Coordinar i optimitzar els esforços nacionals és particularment vital, tenint en compte els recursos limitats i els importants reptes que afronta. L'Acadèmia té la seu a Jerusalem, amb oficines addicionals a Ramallah i Gaza.
