IFSM és membre des de 1976.
La Federació Internacional de Societats de Microscòpia va ser creada per l'ICSU l'any 1951 com a Comissió Conjunta de Microscòpia Electrònica. Es va convertir en una federació independent, amb l'objectiu d'afavorir la cooperació internacional entre microscopistes, l'any 1955. La federació té tres Comitès Regionals, 38 Societats Membres nacionals i 6 Societats Membres Associades Nacionals.