L'Acadèmia Txeca de Ciències n'és membre des de 1922.
L'Acadèmia de Ciències de la República Txeca és una de les organitzacions successores de l'Acadèmia de Ciències de Txecoslovàquia, que representava Txecoslovàquia a l'ISC a partir de 1952. Abans, Txecoslovàquia estava representada pel Consell Nacional d'Investigació Txecoslovàquia. L'Acadèmia de Ciències funciona com una associació de 54 instituts de recerca en els camps de les ciències naturals i tècniques, les ciències socials i les humanitats. És responsable del funcionament de 36 Comitès Nacionals i representa la República Txeca a l'ISC, els seus Comitès i Unions Científices. Els comitès nacionals estan formats per representants d'universitats i institucions de recerca de la República Txeca. Va canviar el seu nom el gener de 2015 a l'Acadèmia Txeca de Ciències.